Tan sólo unas semanas después del lanzamiento de "Pokémon esmeralda", la que seguramente sea la penúltima versión de esta famosa saga en GBA antes de dar el salto a DS, llega a GameCube "Pokémon XD". Tras este simpático “smiley” y con el subtítulo de “Tempestad Oscura”, se nos presenta la continuación más o menos directo del anterior "Pokémon Colosseum", heredero directo de los ya clásicos "Pokémon Stadium" para N64. Si bien en estos dos juegos la gracia estaba en trasladar nuestros pokémon de Game Boy a la consola de sobremesa para verlos luchar en tres dimensiones, los juegos de GameCube han destacado por intentar ofrecer una sólida experiencia tanto monojugador como multijugador. Así, el primer Colosseum nos ofrecía una historia al más puro estilo RPG de unas 40 horas de duración, en la que gracias a las Cepoball debíamos arrebatar a los pokémon oscuros de sus malvados entrenadores para purificarlos y devolverles un corazón limpio.
5 años han pasado en la región del Aura, y los investigadores pokémon continúan desarrollando el purificador pokémon y el lanzador de cepo ball para un caso de emergencia. Ese caso está a la vuelta de la esquina, ya que el malvado grupo Cífer secuestra al profesor Cío, y sólo nosotros podremos ayudar a rescatarlo y purificar una nueva oleada de pokémon oscuros, incluido el más tenebroso de todos... Lugia Oscuro.